Według podania w uroczystość Nawiedzenia Najświętszej Maryi Panny 1583 r. obraz Matki Bożej w niezwykłych okolicznościach został wyłowiony z Wisły koło Topolna. Wizerunek Maryi w stylu Jasnogórskim jest namalowany na deskach z drzewa iglastego przez nieznanego autora.
Wkrótce po pojawieniu się obrazu wybudowano dla niego kaplicę, a następnie drewniany kościółek. W dniu 4 lipca 1588 r. erygowano w Topolnie k. Pruszcza Pomorskiego parafię Nawiedzenia Najświętszej Maryi Panny. Obraz przyciągał rzesze pielgrzymujących wiernych. W dniu 15 sierpnia 1669 r. powstało Bractwo Różańcowe. W latach 1681 - 1683 wzniesiono murowany barokowy kościół i klasztor, do którego w 1685 r. sprowadzono ojców Paulinów.
W pierwszej połowie XVIII wieku na obraz nałożono bogato zdobione srebrne sukienki. Około 1720 r. Paulini z Częstochowy przekazali do Topolna koronę Matki Bożej - wotum króla Władysława IV, która wcześniej zdobiła Obraz Jasnogórski. Do czasu pierwszego rozbioru Polski sanktuarium przeżywało swój złoty wiek.
Po kasacie zakonu w 1811 r. przez 4 lata zawiadują parafią cystersi z Koronowa, a następnie księża diecezjalni. W latach 1894 - 1911 wykonano poważne remonty kościoła, odnowiono ołtarze i wykonano jedenaście witraży do wszystkich okien. Druga wojna światowa przyniosła duże straty w ruchomym wyposażeniu świątyni.
Pisemne świadectwa licznych cudów i łask wymodlonych za wstawiennictwem Matki Bożej zrabowali wraz z innymi dokumentami parafialnymi zaborcy i okupanci.
W nocy z 4 na 5 marca 1983 r. zrabowano koronę „władysławowską" Matki Bożej, wszystkie historyczne srebrne wota, barokową monstrancję i kielich oraz inne wartościowe przedmioty. W dniu 8 grudnia 1988 r obraz Matki Bożej zostaje ozdobiony kopią zrabowanej korony.
Kościół posiada sześć ołtarzy bocznych. Świątynia ma bogate wyposażenie wnętrz w stylu barokowo - rokokowym.